Protein–RNA interactions for Protein: P51911

CNN1, Calponin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN1P51911 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN1P51911 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN1P51911 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CNN1P51911 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CNN1P51911 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CNN1P51911 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNN1P51911 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNN1P51911 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN1P51911 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN1P51911 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN1P51911 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN1P51911 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNN1P51911 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNN1P51911 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNN1P51911 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNN1P51911 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNN1P51911 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN1P51911 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN1P51911 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN1P51911 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN1P51911 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN1P51911 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNN1P51911 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN1P51911 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN1P51911 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN1P51911 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN1P51911 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CNN1P51911 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.5 ms