Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gbx2P48031 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbx2P48031 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbx2P48031 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms