Protein–RNA interactions for Protein: P38176

AVT5, Vacuolar amino acid transporter 5, yeastyeast

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT5P38176 GPD2YOL059W 1323 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 TMT1YER175C 900 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 MRS3YJL133W 945 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 JJJ3YJR097W 519 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 DAP1YPL170W 459 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RPO26YPR187W 468 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 SMF2YHR050W 1650 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 PDC1YLR044C 1692 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ENT2YLR206W 1842 nt5.02□□□□□ -1.61
AVT5P38176 SIA1YOR137C 1869 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 MSS1YMR023C 1581 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 PTC3YBL056W 1407 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 SIP2YGL208W 1248 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YJU2YKL095W 837 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 TSR2YLR435W 618 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YMC1YPR058W 924 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 snR32snR32 188 nt5.01□□□□□ -1.61
AVT5P38176 UIP5YKR044W 1332 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 EXG1YLR300W 1347 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ARO10YDR380W 1908 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RPT3YDR394W 1287 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 PIC2YER053C 903 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 NCS6YGL211W 1080 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YHR140WYHR140W 720 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YKR045CYKR045C 552 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 TAL1YLR354C 1008 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 FPR3YML074C 1236 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YNR068CYNR068C 819 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 FSF1YOR271C 984 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 AIM17YHL021C 1398 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 NOP7YGR103W 1818 nt5□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RIX7YLL034C 2514 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ZWF1YNL241C 1518 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ERP5YHR110W 639 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YJR084WYJR084W 1272 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RDL2YOR286W 450 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 COX11YPL132W 903 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RET1YOR207C 3450 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YTP1YNL237W 1380 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ABZ1YNR033W 2364 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 MCX1YBR227C 1563 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 AMD2YDR242W 1650 nt4.99□□□□□ -1.61
AVT5P38176 PWP1YLR196W 1731 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 IMG1YCR046C 510 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 DBP8YHR169W 1296 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YBR027CYBR027C 333 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ILV6YCL009C 930 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ICE2YIL090W 1476 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 HPF1YOL155C 2904 nt4.98□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YME1YPR024W 2244 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 HSF1YGL073W 2502 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 SRP101YDR292C 1866 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 ERG1YGR175C 1491 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 CDC10YCR002C 969 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 BUG1YDL099W 1026 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 SKG1YKR100C 1068 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RPS3YNL178W 723 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 YNL095CYNL095C 1929 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 RPT2YDL007W 1314 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 PCL10YGL134W 1302 nt4.97□□□□□ -1.61
AVT5P38176 EMW1YNL313C 2715 nt4.96□□□□□ -1.61
AVT5P38176 SIT1YEL065W 1887 nt4.96□□□□□ -1.61
AVT5P38176 IMA2YOL157C 1770 nt4.96□□□□□ -1.61
AVT5P38176 CHL4YDR254W 1377 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 PKC1YBL105C 3456 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 RAD59YDL059C 717 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 UGX2YDL169C 672 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SCS7YMR272C 1155 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 AIM41YOR215C 558 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 YPR150WYPR150W 522 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 TAE1YBR261C 699 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 YEH1YLL012W 1722 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 ERG7YHR072W 2196 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 ACS2YLR153C 2052 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 ATG18YFR021W 1503 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 VRP1YLR337C 2454 nt4.96□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SEC18YBR080C 2277 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 GUP2YPL189W 1830 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 NRD1YNL251C 1728 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 RRP1YDR087C 837 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 COS6YGR295C 1146 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP2tY(GUA)D 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP11tY(GUA)F1 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP6tY(GUA)F2 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP7tY(GUA)J1 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP4tY(GUA)J2 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP5tY(GUA)M1 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP8tY(GUA)M2 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SUP3tY(GUA)O 75 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 BUD14YAR014C 2130 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 YML012C-AYML012C-A 378 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 CWC25YNL245C 540 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 SGF29YCL010C 780 nt4.95□□□□□ -1.62
AVT5P38176 IDP1YDL066W 1287 nt4.94□□□□□ -1.62
AVT5P38176 RPN11YFR004W 921 nt4.94□□□□□ -1.62
AVT5P38176 CUP2YGL166W 678 nt4.94□□□□□ -1.62
AVT5P38176 YJL171CYJL171C 1191 nt4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.3 ms