Protein–RNA interactions for Protein: P35710

Sox5, Transcription factor SOX-5, mousemouse

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox5P35710 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sox5P35710 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sox5P35710 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox5P35710 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox5P35710 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox5P35710 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox5P35710 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sox5P35710 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sox5P35710 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.5 ms