Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcdP28867 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcdP28867 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PrkcdP28867 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcdP28867 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcdP28867 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrkcdP28867 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrkcdP28867 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcdP28867 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcdP28867 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcdP28867 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PrkcdP28867 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcdP28867 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PrkcdP28867 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcdP28867 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcdP28867 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrkcdP28867 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcdP28867 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcdP28867 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrkcdP28867 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PrkcdP28867 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PrkcdP28867 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PrkcdP28867 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms