Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv4P28322 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Etv4P28322 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv4P28322 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Etv4P28322 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv4P28322 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv4P28322 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Etv4P28322 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms