Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gadd45bP22339 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gadd45bP22339 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45bP22339 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gadd45bP22339 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms