Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PdgfaP20033 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PdgfaP20033 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PdgfaP20033 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PdgfaP20033 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms