Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P18527 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18527 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18527 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P18527 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P18527 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P18527 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18527 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18527 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18527 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18527 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18527 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18527 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18527 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18527 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P18527 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P18527 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18527 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18527 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18527 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18527 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18527 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P18527 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms