Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcl1P12850 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxcl1P12850 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cxcl1P12850 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cxcl1P12850 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms