Protein–RNA interactions for Protein: P12656

Tshb, Thyrotropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TshbP12656 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TshbP12656 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TshbP12656 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TshbP12656 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TshbP12656 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TshbP12656 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TshbP12656 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TshbP12656 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TshbP12656 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TshbP12656 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TshbP12656 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TshbP12656 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TshbP12656 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TshbP12656 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TshbP12656 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TshbP12656 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TshbP12656 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TshbP12656 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TshbP12656 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TshbP12656 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TshbP12656 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TshbP12656 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TshbP12656 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TshbP12656 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TshbP12656 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TshbP12656 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TshbP12656 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TshbP12656 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TshbP12656 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TshbP12656 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TshbP12656 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TshbP12656 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TshbP12656 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms