Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP10400 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP10400 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP10400 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PolP10400 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PolP10400 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PolP10400 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PolP10400 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PolP10400 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PolP10400 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PolP10400 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PolP10400 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PolP10400 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP10400 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms