Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UbbP0CG49 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UbbP0CG49 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UbbP0CG49 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms