Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-AaP01910 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-AaP01910 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-AaP01910 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-AaP01910 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-AaP01910 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
H2-AaP01910 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms