Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01629 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01629 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01629 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01629 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01629 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01629 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01629 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01629 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01629 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01629 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01629 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01629 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01629 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01629 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01629 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01629 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01629 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01629 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01629 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01629 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01629 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01629 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01629 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01629 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01629 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
P01629 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01629 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01629 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01629 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01629 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01629 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01629 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01629 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01629 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01629 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01629 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01629 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01629 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms