Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf18O35714 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf18O35714 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf18O35714 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf18O35714 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms