Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rabep1O35551 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rabep1O35551 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rabep1O35551 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rabep1O35551 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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