Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Abcc1O35379 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Abcc1O35379 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc1O35379 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc1O35379 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms