Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn4O35054 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn4O35054 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn4O35054 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn4O35054 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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