Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vmn2r88L7N1W8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn2r88L7N1W8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn2r88L7N1W8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms