Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r34G3XA52 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vmn1r34G3XA52 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r34G3XA52 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms