Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zkscan2G3X952 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Zkscan2G3X952 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Zkscan2G3X952 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Zkscan2G3X952 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms