Protein–RNA interactions for Protein: E9Q166

Atad2b, ATPase family, AAA domain-containing 2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2bE9Q166 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Atad2bE9Q166 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Atad2bE9Q166 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Atad2bE9Q166 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Atad2bE9Q166 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Atad2bE9Q166 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms