Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Sfta2E9PXB6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sfta2E9PXB6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfta2E9PXB6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sfta2E9PXB6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms