Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Brpf1B2RRD7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Brpf1B2RRD7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Brpf1B2RRD7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Brpf1B2RRD7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms