Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV5

Gm13119, Predicted gene 13119, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13119B1ARV5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm13119B1ARV5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm13119B1ARV5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm13119B1ARV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms