Protein–RNA interactions for Protein: A2APT9

Klhdc7a, Kelch domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc7aA2APT9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Klhdc7aA2APT9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhdc7aA2APT9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhdc7aA2APT9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhdc7aA2APT9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms