Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam71e1A1L3C1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam71e1A1L3C1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam71e1A1L3C1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fam71e1A1L3C1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.1 ms