Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
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Tuba8Q9JJZ2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Tuba8Q9JJZ2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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