Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C11orf49Q9H6J7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms