Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VN1R3Q9BXE9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms