Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Derl1Q99J56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms