Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC141Q6ZP82 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC141Q6ZP82 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms