Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms