Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cpne9Q1RLL3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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