Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLFQ13129 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RLFQ13129 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RLFQ13129 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RLFQ13129 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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