Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC8Q09428 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC8Q09428 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC8Q09428 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC8Q09428 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC8Q09428 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms