Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDC42EP1Q00587 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms