Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Hoxd13P70217 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hoxd13P70217 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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