Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TTPAP49638 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TTPAP49638 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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