Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
P10404 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
P10404 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
P10404 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P10404 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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