Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmbr1Q9JIT0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmbr1Q9JIT0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms