Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AC137695.1-201ENST00000604126 489 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SGIP1Q9BQI5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms