Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Sin3bQ62141 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms