Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
DUSP28Q4G0W2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
DUSP28Q4G0W2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms