Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VPS72Q15906 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VPS72Q15906 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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