Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ALX1Q15699 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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ALX1Q15699 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ALX1Q15699 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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