Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BPTFQ12830 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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