Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RykQ01887 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
RykQ01887 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms