Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ASIC1P78348 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms